Epitopea进入临床:共享型aeTSA疫苗的免疫肽组学底牌

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癌症免疫治疗对”自身抗原”的回避正在松动。过去二十年,领域把大部分筹码押在突变新抗原上:肿瘤突变负荷越高,理论上可被T细胞识别的异常肽段越多。然而临床现实反复提示,高肿瘤突变负担并不必然带来持久的免疫应答,许多预测出的突变肽段甚至从未出现在MHC呈递分子表面[1]。2021年创立于蒙特利尔与剑桥的Epitopea,正试图把这一前提推倒重来——它的核心主张是,真正可被免疫系统攻击、且在患者之间共享的肿瘤特异性抗原,大多并不来自编码区的点突变,而来自基因组中被长期称为”垃圾DNA”的非编码区异常表达[2]

这一科学叙事的源头是蒙特利尔大学免疫与癌症研究所Claude Perreault与Pierre Thibault团队。Thibault是质谱与免疫肽组学领域的资深方法学家,Perreault则是肿瘤免疫学与T细胞生物学方向的权威;两人多年的合作建立了一套以免疫肽组学-蛋白质基因组学为核心的抗原发现流程。Epitopea的专有平台CryptoMap即由此衍生:先以质谱直接鉴定肿瘤细胞表面MHC-I所呈递的肽段,再将这些肽段映射回全基因组与转录组数据,从而找出在正常组织中不表达、却在特定癌种中异常表达并被呈递的肽段,公司称之为Cryptigen肿瘤特异性抗原[5]。与个体化新抗原疫苗需要为每位患者单独设计不同,Cryptigen抗原是共享的——同一肿瘤类型的多数患者可能携带相同或高度相似的呈递肽段,这使”现货型”mRNA疫苗成为可能。

这一路线在公开文献中有扎实的铺垫。2018年《Science Translational Medicine》上,Laumont等人在小鼠肿瘤模型与七例人原发肿瘤中鉴定出40个肿瘤特异性抗原,其中约90%来自所谓的非编码区,且多数并非由突变产生;研究还指出,TSA疫苗后的抗肿瘤反应强度与两个可被人源估算的参数相关:抗原表达水平与预存T细胞库中的应答频率[2]。2020年,同一团队又在《Cancer Immunology Research》报道卵巢癌中的大量共享肿瘤抗原[3];2024年《Journal of Clinical Investigation》的乳腺癌研究中,Kina等人进一步将经典免疫肽组与蛋白质基因组学结合,比较激素受体阳性与三阴性乳腺癌的呈递谱,发现三阴性乳腺癌中存在丰富的共享aeTSA,且这些抗原的预测呈递与患者生存优势相关[4]。2025年《Nature Cancer》的工作则是迄今最系统的总结:对505例皮肤黑色素瘤与90例非小细胞肺癌进行蛋白质基因组分析,589个肿瘤抗原中只有1%来自突变序列,99%来自未突变的癌症特异性序列、癌症过表达序列或谱系特异性序列[1]

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图1 Apavaloaei等人在《Nature Cancer》(2025)中对505例黑色素瘤与90例非小细胞肺癌进行蛋白质基因组分析的核心结论:589个肿瘤抗原中仅1%源自突变序列,99%来自未突变的癌症特异性序列(aeTSA)、癌症过表达序列(TAA)或谱系特异性序列(LSA)。图源:Apavaloaei et al., Nat Cancer 2025 (DOI: 10.1038/s43018-025-00979-2; CC BY 4.0)

对质谱方法学背景的人而言,这一系列论文的价值在于把”免疫肽组学看见什么”与”肿瘤抗原从哪里来”这两个问题直接挂钩。传统突变新抗原预测依赖外显子测序与MHC结合算法,但预测肽段在真实免疫肽组中的检出率一向不高;Perreault-Thibault路线则反其道而行,先用质谱看见真实被呈递的肽段,再用基因组学解释其来源。这一策略的技术门槛不低:需要大量肿瘤样本的免疫肽组数据、高质量的多组学整合、以及严格的正常组织表达过滤。Epitopea在官网宣称,CryptoMap通常可在每种肿瘤类型中鉴定出约100个aeTSA,并据此 prioritise 最优表达与免疫识别效率的抗原组合[5]

资本的流向验证了这条路径的吸引力。Epitopea于2021年12月完成1360万美元种子轮,由Advent Life Sciences与CTI Life Sciences共同领投,Cambridge Innovation Capital、Fonds de solidarité FTQ、Harrington Discovery Institute/University Health Holdings、Novateur Ventures参与[6];2024年10月,公司又完成3100万美元pre-Series A融资,新加入的投资者包括Investissement Québec、adMare BioInnovations与Jonathan Milner,原有股东跟投,累计融资超过4500万美元[7]。估值未在公开报道中披露。

融资轮次 时间 金额 主要投资方
种子轮 2021年12月完成/2022年4月官宣 1360万美元 Advent Life Sciences、CTI Life Sciences、Cambridge Innovation Capital、Fonds de solidarité FTQ、Harrington Discovery Institute/University Health Holdings、Novateur Ventures
pre-Series A 2024年10月 3100万美元 Investissement Québec、adMare BioInnovations、Jonathan Milner(新进);原有股东跟投

商业化的关键节点出现在2024年至2026年。2024年7月,Epitopea任命Alan C. Rigby为首席执行官,Jon Moore转任首席科学官。Rigby此前是HiberCell的联合创始人、总裁兼CEO,该公司累计融资超过2.5亿美元;他还曾在Warp Drive Bio、Synta Pharmaceuticals与礼来公司担任高管,并有哈佛医学院PI经历[8]。2025年2月,Epitopea与默沙东(MSD)达成许可与研究合作协议:Epitopea使用CryptoMap平台为某一预设实体瘤类型鉴定免疫原性Cryptigen抗原,默沙东获得由此开发治疗产品的独家权利;公开披露的条款包括未公布金额的首付款,以及每个产品最高可达3亿美元的里程碑付款[9]。2026年4月,公司宣布其首款人体临床试验OVACT获英国药品与保健品监管机构及区域伦理委员会批准,试验药物为CryptiVax-1001,针对HRP+/BRCA野生型晚期高级别浆液性卵巢癌;该试验为I/Ib期剂量递增与扩展研究,主要终点包括安全性、耐受性、免疫原性与早期临床活性,并由皇家马斯登医院的Susana Banerjee教授担任首席研究者[10]

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图2 Epitopea关键节点时间线:2021年创立于蒙特利尔与剑桥;2022年完成1360万美元种子轮;2024年完成3100万美元pre-Series A并任命Alan C. Rigby为CEO;2025年与默沙东达成最高3亿美元里程碑的合作;2026年4月OVACT临床试验获英国监管机构批准。笔者自绘(ai generated)

从商业定位看,Epitopea选择的是一个差异化明显的切口。高级别浆液性卵巢癌约80%患者在初诊时已是晚期或转移性,多数患者最终会对铂类药物产生耐药;在HRP+/BRCA野生型人群中,现有维持治疗选择有限,这恰好构成免疫治疗可以介入的窗口[10]。公司把CryptiVax-1001定位为一线维持治疗,而非末线挽救,这意味着如果早期临床数据积极,其商业化路径可能比对晚期末线患者更友好。然而,卵巢癌疫苗领域并非没有教训:历史上多种癌症疫苗在该适应症中未能转化为显著生存获益,免疫抑制性肿瘤微环境与抗原异质性始终是难以绕过的障碍。

外部评价整体偏正面,但也不乏审慎。《GEN》在2026年4月的报道中将其列为”工程化生物学对抗癌症”案例之一,引用了Rigby的观点:传统精准治疗只探索了基因组的2%,而深度经验性质谱现在可以更深入地探查MHC呈递谱[11]。公司科学顾问委员会在2026年持续扩容,4月新增肿瘤免疫学家Lisa Butterfield,此前已引入Michael Kalos等T细胞治疗与免疫治疗专家[8][12]。不过,作为 pre-Series A 阶段公司,Epitopea迄今尚未披露任何人体临床数据;OVACT刚获批准,真正的免疫原性与临床活性验证尚未开始。其与默沙东的合作虽然提供了重要的制药工业背书,但具体靶点与肿瘤类型均未公开,这意味着外部观察者难以评估该合作的实际价值。

竞争格局上,Epitopea并非唯一押注共享aeTSA的公司。同赛道上,Enara Bio的EDAPT平台同样瞄准暗抗原,并以T细胞衔接器形式推进;Infinitopes则通过免疫肽组学-病毒载体组合开发现货型治疗性癌症疫苗。Epitopea的差异在于其科学根基直接来自Perreault-Thibault团队多年发表的高通量免疫肽组学数据,且其首批临床项目明确指向一个未被PARP抑制剂覆盖的卵巢癌人群。但共享抗原策略的普遍风险在于:当抗原在正常组织中完全静默时,其免疫原性可能最强,却也意味着对肿瘤选择性表达的验证必须极为严格;一旦脱靶,自身免疫毒性将难以控制。

综合来看,Epitopea的叙事把免疫肽组学从”发现工具”提升为”药物设计起点”。它用质谱证明大量肿瘤抗原并非来自突变,再用mRNA疫苗把这些共享抗原变成可及的治疗产品。这个逻辑的每一步都有已发表数据支撑,但公司层面的转化——从抗原库到临床获益——仍处于最早期阶段。2026年OVACT的启动将是第一个真正意义上的试金石。

References

  1. Apavaloaei A et al. Tumor antigens preferentially derive from unmutated genomic sequences in melanoma and non-small cell lung cancer. Nat Cancer. 2025;6(8):1419-1437. DOI: 10.1038/s43018-025-00979-2
  2. Laumont CM et al. Noncoding regions are the main source of targetable tumor-specific antigens. Sci Transl Med. 2018;10(470):eaau5516. DOI: 10.1126/scitranslmed.aau5516
  3. Zhao Q et al. Proteogenomics Uncovers a Vast Repertoire of Shared Tumor-Specific Antigens in Ovarian Cancer. Cancer Immunol Res. 2020;8(4):544-555. DOI: 10.1158/2326-6066.CIR-19-0541
  4. Kina E et al. Breast cancer immunopeptidomes contain numerous shared tumor antigens. J Clin Invest. 2024;134(1):e166740. DOI: 10.1172/JCI166740
  5. Epitopea. Our Science — CryptoMap platform and Cryptigen TSAs. https://www.epitopea.com/our-science/ (accessed 2026-09-22)
  6. Epitopea. Epitopea Announces $13.6 Million Financing to Advance Cancer Immunotherapeutics. Press release, 2022-04-25. https://www.epitopea.com/epitopea-announces-14-million-financing-to-advance-cancer-immunotherapeutics/
  7. Epitopea. Epitopea Closes USD 31 Million Pre-Series A Financing. Press release, 2024-10-24. https://www.epitopea.com/epitopea-closes-usd-31-million-pre-series-a-financing/
  8. Epitopea. Epitopea Announces Leadership Transition and New Appointments. Press release, 2024-07-25. https://www.epitopea.com/epitopea-announces-leadership-transition-and-new-appointments/
  9. Epitopea. Epitopea Announces License and Research Collaboration Agreement with MSD to Identify Cryptigen Tumor-Specific Antigens. Press release, 2025-02. https://www.epitopea.com/epitopea-announces-license-and-research-collaboration-agreement-with-msd-to-identify-cryptigentm-tumor-specific-antigens/
  10. Epitopea. Epitopea Announces Approval of OVACT Clinical Trial Application for CryptiVax-1001 in Advanced High-Grade Serous Ovarian Cancer. Press release, 2026-04-23. https://www.epitopea.com/epitopea-announces-approval-of-ovact-clinical-trial-application-for-cryptivax-1001-in-advanced-high-grade-serous-ovarian-cancer/
  11. GEN. Engineering Biology to Fight Cancer. Genetic Engineering & Biotechnology News. 2026-04-01. https://www.genengnews.com/?p=330203/
  12. Epitopea. Epitopea Strengthens Scientific Advisory Board with Appointment of Leading Authority in Cancer, Lisa Butterfield. Press release, 2026-04-13. https://www.epitopea.com/epitopea-strengthens-scientific-advisory-board-with-appointment-of-leading-authority-in-cancer-lisa-butterfield/

内容经AI校正和润色,审慎阅读

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