原标题：蛋白质是什么？（中）
蛋白质的结构
这种持续连接的多个氨基酸的组合就是一个多肽的序列，我们把它叫做蛋白质的一级结构，空间表示为一条线；而蛋白质的二级结构就是当我们把线进行缠绕弯曲、摆出的造型。这种造型是通过化学作用力来来实现和维持的。如图，因为作用力的牵引，有的氨基酸就会被拉上去，结构上看就会弯曲起来。
这是一种最简单的叫弯曲的结构，我们把它叫做阿尔法螺旋；其他的二级结构包括也包括一种折叠型构想，如图。大家想象一把剪刀，我们把剪刀收回的时候，剪刀的尖尖就连到一起去了。我们把它叫做贝塔折叠。而除了这两种却常见的结构之外，我们还有比如说贝塔转角、无规卷曲等等。
蛋白质的三级结构是多个二级结构的拓扑。可以理解成二级结构在空间层面的叠加。如图。而形成一个蛋白往往是有不只一个多肽组成的，若干存在三级结构的多肽绞合在一起就成了蛋白质的四级结构。
联系到之前举的例子，这条线就是我们今天说的一级结构；当我们把这条线卷曲盘旋再跟其它的线绕到一起，就能形成一个四级结构。
按照之前概念延伸的话，我们可以说蛋白质组是蛋白质的五级结构了；但是因为这个概念还没有被官方界定，所以我们暂时把它定义成4+级结构：若干个蛋白质同时存在于一个空间的情况，称为蛋白质的 4+级结构 。它们之间会形成多种相互作用并行使生物功能。
这种示意图在科研作图当中经常使用：每个点表示一个蛋白质，每条连线表示它们的相互关系。它们形成了蛋白质的相互作用网络，我们可以认为它是蛋白质的4+级结构。
蛋白质的4+结构图看起来很复杂，但其实做起来不难。有一个网站叫string，是一个包括了蛋白质相互作用信息的数据库。网站的页面左部有一个选择多个蛋白的选项。我们会把多个蛋白的名字输入进去，如这里的示例；之后点 search。如果说它们有相互关系或疑似的相互关系，string会把他们的相互关系给画出来，如下图。我输入了7个蛋白，其中有5个蛋白是有相互联系的。它们的相互联系不止一条线，说明它们有多种相互关系，可能是来自于不同文献的报道、或是来自于在不同条件下的实验等等。图中有两个有特点的蛋白是作为大家相互作用的枢纽，如果没有这两个蛋白的话，其余蛋白就不能起到联系。而还有两个蛋白是孤岛蛋白，跟其他蛋白都没有作用。同时这个网站还给出了我们这些蛋白的一些功能的注释。因为这7个蛋白里面有5个都起了相互作用，最显著的、涉及到最多蛋白的一些作用功能就被优先列出来。
